Les 100 navires du territoire exploitent leur activité du port d’Hendaye au Sud à Mimizan au Nord. Les deux principaux ports de pêche sont les ports de Saint Jean de Luz-Ciboure sur la côte basque et de Capbreton dans les Landes.
Toutefois, les ports de plaisance d’Hendaye dans la baie de Txingudi et d’Anglet à l’embouchure de l’Adour accueillent quelques navires de pêche. Les couralins de l’estuaire de l’Adour se concentrent essentiellement à Mouguerre bien que l’on en retrouve d’Anglet en aval à Urt en amont.