Cette flottille se compose de 100 navires qui exploitent leur activité à partir de ports situés dans les Pyrénées Atlantiques et des Landes.
Il s’agit principalement de petites unités dont la taille varie de 5 à 24 mètres. Ces bateaux pratiquent généralement des marées à la journée (4 à 5 jours maximum) et embarquent de 1 à 11 navires selon leur activité. Ils pratiquent une grande variété de métiers : filet, palangres et lignes, canne, chalut, casier, pêche estuarienne et ramassage des algues rouges.
Les 100 bateaux du territoire se répartissent de la façon suivante :
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